Diferencias entre FAT y NTFS.

FAT
File Allocation Table es un sistema primario de archivos para varios sistemas operativos, la mayoría DOS, incluyendo DR-DOS, OpenDOS, freeDOS, MS-DOS, Microsoft Windows (hasta incluir a Windows Me). FAT tambien puede referirse cómo FAT12.

El sistema de archivo es un método para almacenar y organizar archivos y los datos que contienen para que sea fácil de encontrar y acceder a ellos.La lista que se encuenta debajo muestra en que sistema FAT debería ser formateado un dispositivo
FAT12 FAT16 FAT32
Tamaño máximo del dispositivo 32MB 2GB 2TB


NTFS
NTFS es el sistema de archivos standard de Windows NT, incluyendo a las siguientes versiones Windows 2000, Windows XP, Windows Vista, Windows Server 2003, y Windows Server 2008.

NTFS posee varias mejoras con respecto a FAT como el mejor apoyo para la metadata y el uso de estructuras de datos avanzadas para mejorar el rendimiento, la fiabilidad, y la utilización del espacio de los discos, además de otras extensiones adicionales como la seguridad en las listas de control de acceso y sistema de archivos diarios.